Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms