Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc43Q9CR29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc43Q9CR29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms