Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otub2Q9CQX0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otub2Q9CQX0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Otub2Q9CQX0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms