Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms