Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdm1Q9CQK3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms