Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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