Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms