Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms