Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms