Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930550L24RikQ99PA7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms