Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkd1Q99MH6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms