Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms