Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms