Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abtb1Q99LJ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abtb1Q99LJ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms