Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms