Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab28Q99KL7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab28Q99KL7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rab28Q99KL7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rab28Q99KL7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab28Q99KL7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab28Q99KL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab28Q99KL7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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