Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1bQ99JY6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms