Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms