Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms