Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prss28Q924N9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prss28Q924N9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prss28Q924N9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms