Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms