Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms