Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms