Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms