Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb6Q922F4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms