Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncbQ91ZZ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms