Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms