Protein–RNA interactions for Protein: Q91XC9

Pex16, Peroxisomal membrane protein PEX16, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex16Q91XC9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex16Q91XC9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pex16Q91XC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms