Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp6Q91WS2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms