Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms