Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms