Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abcc2Q8VI47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc2Q8VI47 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms