Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms