Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms