Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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