Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul7Q8VE73 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul7Q8VE73 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul7Q8VE73 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms