Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TgdsQ8VDR7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms