Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms