Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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