Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sco2Q8VCL2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sco2Q8VCL2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms