Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf8Q8VC56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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