Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms