Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops8Q8VBV7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms