Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Impg1Q8R1W8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Impg1Q8R1W8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Impg1Q8R1W8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Impg1Q8R1W8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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