Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms