Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r189Q8K3N3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r189Q8K3N3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms