Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms