Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl47Q8K2Y7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms