Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Commd9Q8K2Q0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd9Q8K2Q0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms