Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrdQ8K2M3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms